宋建炎元年五月，大宋北伐軍凱旋陳橋驛，三大主將領(lǐng)全軍十余萬將士奏請?zhí)熳佣U位魯王，宋朝最后一位皇帝，第一位女皇帝趙嬛嬛欣然應(yīng)允，頒下禪位詔書，祭告宗廟后，便將帝位傳位魯王扈嵐。
扈嵐得承帝位，詔命群臣，建號大元，定都燕京為中京，仿宋例定五京，以會寧府為北京，開封為南京，山東濟(jì)州府自己發(fā)跡之地為東京，山西太原府為西京。三娘定五京，首次有關(guān)外州府為京，又將都城定在燕京，顯示了她想要控制北地，徹底斷絕來自漠北游牧族的威脅。
本來群臣大多都反對遷都燕京的，原因很簡單，燕京那里人口太少，水運(yùn)漕運(yùn)也不及開封便利，實(shí)在不是帝都的首選，但三娘還是力排眾議，定下便在次年遷都，便還有一年時光準(zhǔn)備。
定下國號與國都之后，三娘改年號為宣武，以次年為宣武元年，冊封魯王世子扈宗明為太子。改宋朝官制，建立元朝官制，正式建立中書省總理政務(wù)，以太子扈宗明為中書令，此后中書令均由元朝皇太子兼領(lǐng)，定為虛銜。中書省長官，中書令以下，設(shè)左、右丞相為實(shí)任的宰相，以宗澤為左相，宿元景為右相。下設(shè)平章政事四員、左右丞各一員、參知政事兩員為副相，以李綱、黃裳、汪藻、楊時為平章政事，黃文炳為左丞，婁敏中為右丞，聞煥章、高俅為參知政事。
扈元朝的中書省自中書令以下，實(shí)權(quán)人物共有十人，便是替皇帝掌控全國軍政大事的中樞，中書省也被后世稱為十人內(nèi)閣，得入中書省的都頂著各殿大學(xué)士的名號，后為常例。
軍事上，三娘保留了樞密院，設(shè)樞密使正副各一人，以種師中為樞密使，盧俊義為樞密副使，種師中年事已高，其實(shí)樞密院的實(shí)權(quán)都在盧俊義手中。再設(shè)樞密院同治六人，分別委以關(guān)勝、岳飛、林沖、王稟、王彥、呼延灼六人出任。樞密院在三娘的官制體系中更偏向?qū)嶋H領(lǐng)軍作戰(zhàn)，自扈元朝開國之后，每遇戰(zhàn)事都是樞密院內(nèi)將領(lǐng)出征領(lǐng)軍作戰(zhàn)。
樞密院內(nèi)還設(shè)參謀部、情報司、海軍部三個要害部門。參謀部便是樞密院評估周邊諸國實(shí)力，推演與假想敵作戰(zhàn)方略，擬定各種作戰(zhàn)計(jì)劃，編練天下軍馬之地。情報司顧名思義便是搜集情報的地方，情報司是偏重軍事情報搜集，處于明面上的情報機(jī)構(gòu)，而錦衣衛(wèi)始終是三娘親自掌管的大內(nèi)情報機(jī)構(gòu)，二者互不重疊。海軍部便是掌管天下海軍的部門，編練天下海軍、內(nèi)河水軍，沿岸、沿河防務(wù)都屬這個部門。
參謀部便是朱武為首，官拜樞密院僉事，下首有唐斌、文仲容、孫安、李應(yīng)、朱仝、楊志六員大將為輔，官拜樞密院院判。情報司以燕青為首，官拜樞密院僉事，下首馬靈、鄭鷹、時遷、白勝四人為輔，官拜樞密院院判。
海軍部以李俊為首，旗下轄四大海軍艦隊(duì)并長江、黃河兩大南北水系內(nèi)河水軍。四大艦隊(duì)便是北海艦隊(duì)、南海艦隊(duì)、東海艦隊(duì)以及遠(yuǎn)洋艦隊(duì)，分別以阮小二、阮小五、阮小七、張順為提督，總領(lǐng)四大艦隊(duì)，“赤須龍”費(fèi)保、“卷毛虎”倪云、“瘦臉熊”狄成、“太湖蛟”卜青四人分為四大艦隊(duì)副提督。另有張橫為內(nèi)河水師總提督，童威童猛兩兄弟分別為南北水師提督。
樞密院下設(shè)六部，與宋制相同，也一般的是吏部、工部、戶部、禮部、刑部、兵部。每部尚書改為一員，每部侍郎改為六人，每部配屬簿書、文吏、算官若干。
凡分受官員稟奏，吏部主管封賞之外，還要管各地官吏的任免、官吏的年績核考、官吏升遷降職等事務(wù)。與宋制不同的是，三娘將各州縣小吏也定了品級，正式納入官員體系，也一般的有升遷調(diào)度，而不是像宋朝那樣，小吏永遠(yuǎn)只是小吏，干了幾十年還是一個小吏，而且小吏也能通過考核正式升任官員，只不過考核的內(nèi)容比較變態(tài)，難度很高，除了在任時候的政績之外，還要有一技之長，然后是嚴(yán)格的考試，考試題目自然是類似后世的公務(wù)員考試，只不過扈元朝的公務(wù)員考試更注重實(shí)用。
戶部主管全國錢糧、人丁口數(shù)、農(nóng)田土地?cái)?shù)目、各軍甲器、各種牲畜數(shù)目等，總之戶部不僅承擔(dān)了后世統(tǒng)計(jì)局的差事，還兼著漁業(yè)部和農(nóng)業(yè)部的差事。本來三娘想要一次性把后勤部和農(nóng)業(yè)部單獨(dú)剝離出來，但總覺得一下子搞出八部來也太過繁瑣，還是精簡些機(jī)構(gòu)較好，是以在戶部下設(shè)了漁業(yè)司和農(nóng)林司。
而兵部這次官制變動最引人注目的就是兵部之下設(shè)立的兵甲司和后勤司，這兩個司部承擔(dān)的職責(zé)便是把各軍統(tǒng)軍將領(lǐng)手中的權(quán)力剝了過來，錢糧甲器一應(yīng)軍中所需今后由戶部這兩個司承擔(dān)，就不再是一軍將領(lǐng)掌控全軍的錢糧甲器了。這也是三娘早早的把防止手下將領(lǐng)坐大的手段使了出來，只要控制住一軍的錢糧甲器命脈，再強(qiáng)的將領(lǐng)也不能掀起什么風(fēng)浪來，這也意味著三娘對全國軍隊(duì)的控制更加嚴(yán)謹(jǐn)了，今后軍隊(duì)便是國家的軍隊(duì)而不是哪一個將領(lǐng)的軍隊(duì)了。
同時戶部還加入了關(guān)稅司，也就是負(fù)責(zé)海外貿(mào)易的關(guān)稅收取，海商出海必須先交關(guān)稅，而將后來的市舶司功能都加在了關(guān)稅司的職責(zé)上。
禮部承擔(dān)的職司不便，還是禮樂之事、科舉之事和涉外之事，三娘特別加重了理藩院的職責(zé)，并規(guī)定今后前來朝拜的藩屬之國，在還禮之時，定是要公平交易，三娘可不是那些抱著天朝上國的思想，別國進(jìn)貢一些土特產(chǎn)，然后天朝上國為了面子問題，就賜下一些絲綢、茶葉、瓷器等等，每次朝貢還禮都是虧本的。
刑部除了掌管刑罰之外，三娘設(shè)立了監(jiān)察司，主要就是負(fù)責(zé)監(jiān)察百官的規(guī)行。同時刑部被剝奪了頒布刑法的權(quán)利，刑部今后就只管查案、審案、斷案，扈元朝所有的法令皆由中書令頒布。刑部多出的一個司部是警察司，刑部掌管的警察司負(fù)責(zé)管理各地設(shè)立的警察所，就是負(fù)責(zé)維持地方治安。
工部的職司除了之前的興修水利、修橋鋪路、營造屋宇、宮殿、城垣之外，三娘新設(shè)了火器司、船舶司、機(jī)械司三個司部。火器司就是負(fù)責(zé)制造、研發(fā)各種火器、火炮、火藥的司部，該司部早在山東路時就存在，當(dāng)時的山東路的工匠們都被集中到一起，專門修繕火器和配制火藥，如今只是正式掛牌而已。船舶司也是在山東路時就有，負(fù)責(zé)管理船只、建造船只。同時船舶司還要該管內(nèi)河航運(yùn)往來的各種船舶，也算是江海事局的前身。機(jī)械司負(fù)責(zé)的事也不少，從礦產(chǎn)勘探到開采、冶煉，以及各種機(jī)械的制造等等。
六部官員和屬員大都是由山東路出身的文官擔(dān)任，他們在山東路實(shí)行的新政已經(jīng)有了很好的經(jīng)驗(yàn)，接下來只是推廣全國的問題而已。而梁山出身的老兄弟中，只因很多都是武將出身，是以在六部擔(dān)任官職的并不多，只有穆弘為兵部尚書，韓韜、彭玘、黃信、孫立等人在兵部任侍郎，鐵面孔目裴宣為刑部尚書，蔡福、蔡慶在刑部任職，九尾龜陶宗旺在戶部農(nóng)林司任職，孟康在船舶司任職，湯隆在兵甲司任職，金大堅(jiān)、蕭讓在禮部任職。
其余梁山老兄弟都是武將出身，三娘在全國設(shè)立了東西南北中五大軍區(qū)，負(fù)責(zé)統(tǒng)領(lǐng)天下兵馬，負(fù)責(zé)戍邊和保衛(wèi)地方。其余梁山武將及田虎、方臘麾下降將都在五大軍區(qū)之內(nèi)擔(dān)任軍職，此間就不一一贅述。總之三娘為跟隨自己的一干老兄弟都安排好了，除了擔(dān)任軍職之外，三十六天罡正將都按戰(zhàn)功封了侯爵或伯爵之位，其余將佐或封男爵、子爵，都有爵位封賞。
扈元朝將地方行政體系也做了改變，將宋朝的一路行政單位改為行省，比如山東路改為山東行省，三娘還是習(xí)慣用行省劃分地方行政區(qū)域，而沒有沿用宋朝的什么一路軍州。行省之下便是府，府之下是州，州之下是縣，縣之下是鄉(xiāng)，鄉(xiāng)之下便是村。三娘在地方管治上一改前朝通病，那便是縣以下便沒有很好的管治，多是鄉(xiāng)民自治。扈元朝在縣之下還設(shè)了鄉(xiāng)和村兩級單位，鄉(xiāng)長和村長一般也是由村民自己推選，不過朝廷加入了監(jiān)察和政績考核，同時也給朝廷俸祿，對縣以下更小的地方行政也有效管治了起來。
同時三娘還設(shè)立了御史監(jiān)察臺，負(fù)責(zé)監(jiān)察全國官吏，設(shè)立了宗正府管理宗室以及各級爵位的公侯們，設(shè)立宣政院管理天下教義，設(shè)立了宣慰司負(fù)責(zé)管理少數(shù)民族事務(wù)。而公孫勝、魯智深、武松等出家人多被封了護(hù)國真人、國師等職位，便在宣政院內(nèi)任職。
而一應(yīng)女軍們也在朝中設(shè)了官職，允許女子出任朝中官職，雖然朝廷允許女子出任官職，但真正在朝廷任職的也只是瓊英、孫二娘、龐秋霞、顧大嫂等跟隨三娘起家的女將，很少有女子真正通過科舉考試做官的。直到后來三娘之子扈宗明繼位后的第五年上，才正式有第一位元朝女子正正經(jīng)經(jīng)通過科舉做官的，到扈宗明登基十年后才出現(xiàn)了第一位科舉女狀元，那都是二三十年之后的事了。